ಮಧುರೈಯಲ್ಲಿ ಒಂದು ದೇಶಿಯ ವಿಮಾನ ನಿಲ್ದಾಣವಿದ್ದು ಇದು ನಗರದಿಂದ ಹತ್ತು ಕೀ.ಮಿ ದೂರದಲ್ಲಿದೆ. ಮುಂಬಯಿ, ದೆಹಲಿ, ಚೆನ್ನೈ, ಬೆಂಗಳೂರು ಮತ್ತು ಇತರ ಪ್ರಮುಖ ನಗರಗಳಿಗೆ ಪ್ರತಿ ನಿತ್ಯವು ಮಧುರೈಯಿಂದ ಹೊರಡುವ ವಿಮಾನಗಳಿವೆ. ಇದಕ್ಕೆ ಹತ್ತಿರದಲ್ಲಿರುವ ಅಂತಾರಾಷ್ಟ್ರೀಯ ವಿಮಾನ ನಿಲ್ದಾಣ ಎಂದರೆ ಚೆನ್ನೈನ ಅಂತಾರಾಷ್ಟ್ರೀಯ ವಿಮಾನ ನಿಲ್ದಾಣ. ಇದು ಭಾರತ ಮತ್ತು ಇತರ ದೇಶಗಳ ಪ್ರಮುಖ ನಗರಗಳಿಗೆ ವೈಮಾನಿಕ ಸಂಪರ್ಕ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.