ಜುನಾ ಜೈನ ಮಂದಿರವನ್ನು 12 ಅಥವಾ13 ನೇ ಶತಮಾನದ ಆಸುಪಾಸಿನಲ್ಲಿ ನಿರ್ಮಿಸಲಾಗಿದೆ. ಇದು ಜುನಾ ಬಾಡಮೇರ್ ಎಂಬ ಸ್ಥಳದಲ್ಲಿದ್ದು, ಸುಂದರವಾದ ಪರ್ವತಗಳ ಮಧ್ಯದಲ್ಲಿದೆ. ಒಂದೊಮ್ಮೆ ಜುನಾ ಬಾಡಮೇರ್ ಪಟ್ಟಣವು ಜನಜಂಗುಳಿಯಿಂದ ತುಂಬಿತ್ತು. ಕ್ರಮೇಣ ಜನರು ಇಲ್ಲಿಂದ ಬೇರೆ ಸ್ಥಳಗಳಿಗೆ ವಲಸೆ ಹೋದರು. ಈ ವಲಸೆ ಹೋದ ಜನರೇ ಈಗಿನ ಬಾಡಮೇರ್ ಅನ್ನು ರೂಪಿಸಿದ್ದಾರೆ ಎಂದು ನಂಬಲಾಗಿದೆ.